Luego pasó por instituciones como Cerro Porteño y Nacional. Su principal logro como adiestrador fue llegar a la final de la Copa Libertadores de 2014, la cual perdió ante San Lorenzo de Almagro.
Ahora, a Morínigo le toca reemplazar a Ramón Díaz, quien renunció tras los magros resultados a nivel local y luego de perder ante el Caracas en Venezuela.
El fin de semana tiene un compromiso ante San Lorenzo, por el Apertura, mientras que la próxima semana visitará a Boca en Argentina, en el marco de la Libertadores.
